ליגות הכדורגל אמנם יצאו לפגרה לפני כחמישה שבועות, אך ספיחים של ענייני משמעת והתנהגות לא תקינה במגרשים הורגשו בדיונים של בתי הדין של ההתאחדות לכדורגל, בר"ג ובנשר, שדנו בשורה של אירועים, רובם התרחשו במחזור האחרון של העונה. אירועים חמורים שקרו בשני מגרשים תפסו פוקוס נכבד בדיונים, שנערכו בר"ג.
שחקן קבוצת הנוער של הפועל שגב שלום ספג עונש הרחקה עד לתחילת שנת 2026, זאת בעקבות התנהגותו במשחק הסיום של העונה מול מ.ס דימונה. שופט המשחק, ליאב דהן, ציין בדו"ח המשחק: "שחקן התבטא בצורה לא מכבדת ומבישה כלפי השופט הראשי ביקשתי ממנו להירגע ואמר את המילים הבאות.
"בן זונה אני אזיין אותך אתה לא מכיר אותי התחיל לירוק בלי הפסקה על השופט הראשי וממש ניסה ליצור מגע פיזי". הדיין, עו"ד נועם ליובין, הרשיע את השחקן בארבעה סעיפים: הפרת סדר, איום, העלבת שופט משחק, התנהגות בלתי הולמת - ועל כן גזר עליו עונש חמור.
קריאות גזעניות והעלבת שופט באותו משחק בקבוצת ילדים ג' של הפועל רעננה צפון עמדה לדין, בעקבות דו"ח שיפוט חמור שכתב השופט, אלירן אדלר, שניהל במחזור האחרון של העונה את המשחק בו אירחה רעננה את מ.ס כפר קאסם.
"לאחר ששרקתי לעבירה לזכות כפר קאסם, אמר לי שחקן של רעננה, שאני "שופט מטומטם". בסיום המשחק, החלו מספר שחקני הפועל רעננה צפון, להטיח אמירות גזעניות לעבר כפר קאסם, אך השיא היה כאשר שחקני הפועל רעננה צפון החלו לשיר "שישרף לכם הכפר", לעבר הקבוצה היריבה מכפר קאסם".
הדיין, עו"ד ישראל שמעוני, הרשיע את רעננה בשני סעיפים: התנהגות בלתי הולמת וקריאות גזעניות. שמעוני גזר על רעננה קנס בגובה 2,000 שקלים. לא פחות מ-13 קבוצות הורשעו בסעיף הופעה ללא מאמן. בחלק מהמקרים הסתפקו הדיינים בנזיפה ללא קנס, בחלק מהמקרים נגזרו קנסות בגובה של 250-500 שקלים על הקבוצות.